Лікарю клініцисту необхідне лабораторне підтвердження природи інфекційного захворювання пацієнта, якого лікар консультує в даний момент. Такий підхід дає можливість визначитися з тактикою терапії хворого.
Чиста культура патогенних та умовно-патогенних мікроорганізмів використовується:

• при постановці антибіотикограми
• в методиці підбору пробіотичних штамів, які проявляють антагоністичну активність у відношені даних бактерій
• при дослідженні біоплівок, ними створюваними -в якості біоматеріалу для виготовлення індивідуальної аутовакцини